Jest to wydajne narzędzie do porównywania plików i folderów. Przykładowe zastosowanie: porównywanie kodów źródłowych, utrzymanie zsynchronizowanych folderów, potwierdzanie kopii danych. Beyond Compare umożliwia tworzenie obrazów struktury folderów i porównywanie ich później z istniejącymi folderami.
Beyond Compare pomaga analizować szczegółowe różnice. Posiada wiele możliwości operacji na plikach i operacji tekstowych, jak i polecenia skryptowe w celu automatyzacji zadań.
Niektóre możliwości programu: - porównywanie plików tekstowych, - porównywanie folderów, archiwów zip i kont ftp, - aktualizacja stron internetowych, - wykrywanie zmian w kodach programów, - porównywanie programów wyjściowych, - i inne.