Darmowy program CCleaner pozwala na usunięcie wszelkich nieprzydatnych i niechcianych plików z dysku twardego komputera. Pliki, którymi zajmuje się CCleaner, to głównie pliki tymczasowe, tworzone przez popularne oprogramowanie - przeglądarki internetowe, programy archiwizujące, dodatki do programów itp.
Program usuwa jednak nie tylko pliki tymczasowe - zajmuje się również historią przeglądania stron, ciasteczkami, zrzutami pamięci operacyjnej w systemie, a także niepełnymi fragmentami plików czy plikami pochodzącymi z dziennika systemu.
Ciekawą funkcjonalnością CCleanera jest czyszczenie także rejestru systemu Windows z niepotrzebnych informacji. Mało kto bowiem wie, że szybkość systemu operacyjnego zależy w dużej mierze od jego rejestru - natomiast wiele programów zaśmieca rejestr Windowsa niepotrzebnymi wpisami. Często po "poprawnym" odinstalowaniu oprogramowania tego typu wpisy nadal pozostają w rejestrze, spowalniając reakcję systemu.
W połączeniu z powyższą funkcjonalnością, programu CCleaner można z powodzeniem użyć także przy usuwaniu całych aplikacji w systemie. Program pozwala dodatkowo zarządzać aplikacjami, które system Windows uruchamia przy swoim starcie. Można tutaj dodać swoje własne programy tak, aby startowały razem z systemem, lub niektóre usunąć, przyspieszając tym samym start Windowsa.
Jednym z rodzajów plików, które zajmują wiele miejsca w systemie, a dla wielu osób okazują się całkowicie nieprzydatne, są punkty przywracania systemu. Tego typu pliki mogą zajmować nawet kilka gigabajtów przestrzeni dyskowej - CCleaner pozwala również ich się wygodnie pozbyć.
Usuwanie krytycznych plików z dysku twardego wymaga czegoś więcej, niż po prostu opróżnienia kosza - CCleaner posiada specjalne narzędzie, Drive Wiper, pozwalające trwale i skutecznie pozbyć się wszelkich danych z komputera (stosowany jest tu wielokrotny zapis na dysku twardym w fizycznym miejscu usuniętego pliku).